Los compuestos halogenados son de uso corriente en la vida cotidiana: disolventes, insecticidas, intermedios de síntesis, etc. No es muy común encontrar compuestos de origen natural que sólo tengan halógenos pero sí con otras funciones. Hay algunos importantes.
Tiroxina
Sustancia segregada por la glándula tiroides: influye sobre el crecimiento, el desarrollo y maduración del organismo, regulación del metabolismo basal, etc.
En la nomenclatura de la IUPAC el halógeno se considera como un sustituyente de la cadena carbonada principal, con su número localizador. Sólo en casos especialmente sencillos los compuestos pueden nombrarse como halogenuros de alquilo.